全自动反冲洗过滤器具有对原水进行过滤并自动对滤芯进行清洗排污的功能，且清洗排污时系统不间断供水。目前全自动反冲洗过滤器控制方式有以下两种：全自动反冲洗过滤器控制方式
(一) 手动控制：
将手动、自动选择开关旋转至手动位置，电机和水力控制阀接通电源，水力控制阀打开，开始排污。选择开关旋转至自动位置，进入自动状态。手动控制状态是检查电机和水力控制阀能否正常工作的手段，如果在手动控制状态不能正常排污全自动控制状态也不会正常工作。
(二)自动控制：
将手动、自动选择开关旋转至自动位置，首先设定过滤时间和排污时间定时器。全自动反冲洗过滤器定时器的下排数码管显示设定值，上排数码管显示计时值。定时器设定方法：按一下位选键，下排个数码管闪烁，用增加键调整数值，调整好再按一下位选键，第二个数码管闪烁，用增加键调整数值，依次类推。设定好时间，数码管继续闪烁8秒，8秒后数值存入内存，且掉电不丢失。调整好数值后，按一下启动键，开始计时。如果机器断电，下一次上电，定时器自动启动，按照设定时间进行计时。